Nachdem die Besatzung des Zivilflugzeugs den Funkkontakt zu den zuständigen Flugsicherungsstellen wieder hergestellt hatte, kehrten die beiden Eurofighter zum Militärflughafen Istrana zurück. Der Befehl zum sofortigen Start, im Fachjargon "Scramble" genannt, wurde vom CAOC (Combined Air Operation Centre) im spanischen Torrejon, erteilt, der für das Gebiet zuständigen NATO-Stelle, in Abstimmung mit dem Aerospace Operations Command (AOC) im italienischen Poggio Renatico.
